大司命正要说出自己的办法，突然听到有人进入，大司命将天明藏进柜子里。赵高挥退大司命，与丞相李斯谈论秘不发丧后，下一步该怎么办。李斯认为应该通知长公子扶苏早点回咸阳主持大局，赵高告诉他自己将始皇立扶苏为太子的遗诏扣押在手中，他认为由胡亥继位更合适。李斯反对赵高擅作主张，不愿与他沆瀣一气。赵高告诉他，自己在数日前已经派人传诏上郡，告知立胡亥为太子，命扶苏自尽谢罪。在赵高的威逼利诱下，李斯只得同意了他的安排。
　　赵高接见了扶苏派来的使臣，想要用三言两句将其打发走，使臣坚持要当面禀报始皇，赵高以皇帝卧病为由拒绝了他的请求。使臣决定当晚赶回上郡，李斯心虚，担心他猜到皇帝驾崩之事，赵高赞李斯心思缜密，立刻派人前去追杀使者。
　　赵高和李斯离开后，大司命将天明从柜子里放出，并将少司命的混元珠交给他，告知让高月贴胸佩戴，可以暂时抵御玉珪之力的侵蚀，但最多可以延长三年的寿命。天明离开始皇的队伍后，一路快马加鞭追赶扶苏的使臣，无奈追上时，使臣已经遇害。使臣拼尽最后一口气，让天明赶快将皇上驾崩的消息告诉扶苏。
　　扶苏和蒙恬接到赵高送来的假圣旨，圣旨上说公子扶苏身为人子而不孝，刺剑以自裁；蒙恬身为人臣而不忠，一并刺死。蒙恬不信始皇会下如此命令，要求验玺印。经验证，玺印是真的，扶苏不知赵高已经掌握了玉玺，只得跪地领旨。蒙恬仍然不信，与使臣拔刀相向，被扶苏拦住。蒙恬要扣押使臣，率兵护送扶苏回咸阳与始皇当面问个清楚。扶苏悲观的认为无论怎么做都是徒劳，蒙恬说自己愿挥师攻入咸阳，取下赵高的狗头，以正国法。扶苏不愿引起战乱、骨肉相残，决意领旨，蒙恬大叹公子糊涂。蒙恬找到盖聂等人商议，说自己要去咸阳面圣讨说法，托盖聂保护扶苏的安全。
　　传旨的特使被蒙恬的士兵拘押，大发雷霆，谁也没有留意到有两个赵高派来的杀手已经偷偷离开了营帐。其中一名杀手，趁扶苏给始皇写信之时潜入帐中，逼扶苏自裁。危急时刻，盖聂赶来将杀手击毙，另一名杀手见到同伴被杀，四处大喊扶苏杀人，意图谋反。特使带来的士兵与蒙恬的士兵呈剑拔弩张之势，盖聂要带扶苏离开，扶苏执意不走，争执中，扶苏被赵高手下的弩箭射伤了肩膀。扶苏不忍将士们自相残杀，挥剑自杀，临死前仍然嘱咐蒙恬辅佐胡亥善待天下百姓。
　　天明一路奔袭，终于回到了子午岭，却得知扶苏已死。天明将得到的情报告诉盖聂，被一心想要为父报仇的子婴听到，子婴不顾盖聂的阻拦，执意回咸阳报仇。蒙恬被赵高用奸计囚禁于阳周，失了兵权。东巡车队回到咸阳，胡亥主持发丧，而后顺理成章登基继位。赵高任郎中令，自此权倾朝野。子婴被送回咸阳，为了让赵高放下戒心，不惜装疯卖傻，口吞碎碗。
　　扶苏死后，墨家失去了辅佐的目标，盖聂也因再失益友而整日借酒浇愁。刘季讲了自己的故事，开导盖聂可以反抗暴秦，挽救天下。端木蓉见不得盖聂再次消沉，说这个世界并不适合所有人，劝他跟自己隐居。